Московский Клинический Научно-практический Центр образован в июле 2013 года на базе Центрального научно-исследовательского института гастроэнтерологии (ЦНИИГ).
Сегодня МКНЦ – это крупное развивающееся многопрофильное учреждение Департамента здравоохранения города Москвы, научный и учебный центр, в составе которого работают специалисты экспертного уровня.